MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bifidobacterium longum subsp. infantis 157F plasmid p157F-NC1

Total Repeats: 105

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015053	CGA	2	6	6	11	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690184
2	NC_015053	TGC	2	6	74	79	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690184
3	NC_015053	GC	3	6	86	91	0 %	0 %	50 %	50 %	322690184
4	NC_015053	GAA	2	6	168	173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322690184
5	NC_015053	GGA	2	6	228	233	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322690184
6	NC_015053	GGAC	2	8	297	304	25 %	0 %	50 %	25 %	322690184
7	NC_015053	TCG	2	6	326	331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690184
8	NC_015053	GCG	2	6	367	372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690184
9	NC_015053	CGGC	2	8	405	412	0 %	0 %	50 %	50 %	322690184
10	NC_015053	GAC	2	6	440	445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690184
11	NC_015053	AGA	2	6	446	451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322690184
12	NC_015053	CAA	2	6	495	500	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322690184
13	NC_015053	CCA	2	6	629	634	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690184
14	NC_015053	CGG	2	6	672	677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690184
15	NC_015053	GAG	2	6	694	699	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322690184
16	NC_015053	CTC	2	6	727	732	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322690184
17	NC_015053	GGC	2	6	755	760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690184
18	NC_015053	CGC	2	6	799	804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690184
19	NC_015053	GC	3	6	818	823	0 %	0 %	50 %	50 %	322690184
20	NC_015053	CGC	2	6	887	892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690184
21	NC_015053	AACG	2	8	985	992	50 %	0 %	25 %	25 %	322690184
22	NC_015053	GGA	2	6	1026	1031	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322690184
23	NC_015053	CCG	2	6	1052	1057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690184
24	NC_015053	ATTG	2	8	1273	1280	25 %	50 %	25 %	0 %	322690185
25	NC_015053	CCAGC	2	10	1391	1400	20 %	0 %	20 %	60 %	322690185
26	NC_015053	AAT	2	6	1443	1448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322690185
27	NC_015053	CTCG	2	8	1456	1463	0 %	25 %	25 %	50 %	322690185
28	NC_015053	GCA	2	6	1467	1472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690185
29	NC_015053	CCA	2	6	1476	1481	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690185
30	NC_015053	CCCG	2	8	1540	1547	0 %	0 %	25 %	75 %	322690185
31	NC_015053	GTG	2	6	1553	1558	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690185
32	NC_015053	CAG	2	6	1630	1635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690185
33	NC_015053	CCG	2	6	1853	1858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690185
34	NC_015053	CATG	2	8	1881	1888	25 %	25 %	25 %	25 %	322690185
35	NC_015053	AGC	2	6	1914	1919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_015053	CCG	2	6	1924	1929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_015053	CGT	2	6	1958	1963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690186
38	NC_015053	ACCG	2	8	1992	1999	25 %	0 %	25 %	50 %	322690186
39	NC_015053	CCG	2	6	2008	2013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690186
40	NC_015053	CGCGG	2	10	2034	2043	0 %	0 %	60 %	40 %	322690186
41	NC_015053	CGAA	2	8	2046	2053	50 %	0 %	25 %	25 %	322690186
42	NC_015053	GCA	2	6	2058	2063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690186
43	NC_015053	CGGC	2	8	2091	2098	0 %	0 %	50 %	50 %	322690186
44	NC_015053	GTCATC	2	12	2119	2130	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	322690186
45	NC_015053	GCC	2	6	2207	2212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690186
46	NC_015053	ATC	2	6	2298	2303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_015053	GCC	2	6	2365	2370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_015053	CCG	2	6	2402	2407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_015053	CAC	2	6	2414	2419	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_015053	GTCT	2	8	2454	2461	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_015053	CGG	2	6	2467	2472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_015053	CGC	2	6	2483	2488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_015053	CAT	2	6	2492	2497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_015053	GCA	2	6	2595	2600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690187
55	NC_015053	CCG	2	6	2646	2651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690187
56	NC_015053	CAC	2	6	2768	2773	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690187
57	NC_015053	CG	3	6	2791	2796	0 %	0 %	50 %	50 %	322690187
58	NC_015053	GCC	2	6	2807	2812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690187
59	NC_015053	TCAAAT	2	12	2829	2840	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	322690187
60	NC_015053	CTT	3	9	2876	2884	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322690187
61	NC_015053	CAG	2	6	2912	2917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690187
62	NC_015053	CTC	3	9	2927	2935	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322690187
63	NC_015053	TTG	2	6	2955	2960	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322690187
64	NC_015053	CGG	2	6	3000	3005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690187
65	NC_015053	CA	3	6	3027	3032	50 %	0 %	0 %	50 %	322690187
66	NC_015053	CCT	2	6	3056	3061	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322690187
67	NC_015053	GAGGT	2	10	3129	3138	20 %	20 %	60 %	0 %	322690187
68	NC_015053	GAT	2	6	3230	3235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690187
69	NC_015053	TTC	2	6	3356	3361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322690187
70	NC_015053	TTG	2	6	3462	3467	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322690187
71	NC_015053	AAT	2	6	3613	3618	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015053	GAAGA	2	10	3745	3754	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015053	GCT	3	9	3773	3781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690188
74	NC_015053	GCT	2	6	3827	3832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690188
75	NC_015053	CCG	2	6	3884	3889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690188
76	NC_015053	GC	3	6	3931	3936	0 %	0 %	50 %	50 %	322690188
77	NC_015053	CGG	2	6	3941	3946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690188
78	NC_015053	CAG	2	6	3966	3971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690188
79	NC_015053	TCG	2	6	3988	3993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690188
80	NC_015053	TCG	2	6	4006	4011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690188
81	NC_015053	GCC	2	6	4041	4046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690188
82	NC_015053	GAT	2	6	4053	4058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690188
83	NC_015053	GC	3	6	4077	4082	0 %	0 %	50 %	50 %	322690188
84	NC_015053	GC	3	6	4116	4121	0 %	0 %	50 %	50 %	322690188
85	NC_015053	GCT	2	6	4127	4132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690188
86	NC_015053	CTC	2	6	4161	4166	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322690188
87	NC_015053	TCC	2	6	4186	4191	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_015053	ATCA	2	8	4208	4215	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_015053	GCA	2	6	4233	4238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_015053	AC	3	6	4259	4264	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_015053	GAA	2	6	4279	4284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015053	TCA	2	6	4325	4330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_015053	GCC	2	6	4342	4347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_015053	CCG	2	6	4349	4354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_015053	CG	3	6	4360	4365	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
96	NC_015053	GGGA	2	8	4378	4385	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015053	ACCG	2	8	4389	4396	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
98	NC_015053	AGC	2	6	4433	4438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_015053	AATC	2	8	4481	4488	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_015053	CGAC	2	8	4554	4561	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
101	NC_015053	GGT	2	6	4639	4644	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015053	GC	3	6	4659	4664	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
103	NC_015053	CGG	2	6	4725	4730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_015053	GCC	2	6	4845	4850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_015053	CCT	2	6	4867	4872	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.